SEQPAD是根据多年生物信息分析和大数据处理经验所开发的一套“软硬兼施”的生物信息分析平台。该平台解决个人用户购买服务器价格昂贵、部署麻烦、定制化服务等诸多问题,完美契合中小课题组需求,经济实用,可移动,更便捷。
一. 配备精悍的移动服务器硬件系统
推荐的模块组合,在此基础上,还可以提供个性化的定制服务
组合类型 |
测序分析能力 |
标准组合 |
转录组:20G(有Ref)/5G(无Ref)、micRNA:5G、microarray的数据:20G、LncRNA:20G |
个性化组合 |
根据客户要求进行安装 |
二.最新最全的专用服务器软件系统
预装linux操作系统,并提供最新最全的生物信息分析软件,强大的软件帮您放大有限的硬件性能。
配备的生物分析软件:
具体分析工作 |
推荐安装软件 |
质量控制 |
FastQC、NGSQCToolkit、Trimmomatic |
转录组分析 |
Tophat、Cuff |
转录组组装 |
Trinity等 |
进化分析 |
Structure、admixture等 |
miRNA分析 |
Bedtools、CutAdapt、HTSeq、Picard、miRDeep2、Vienna、Squid、RandFold、PDF-API2、miRanda、DIANA-microT等 |
序列比对 |
BLAST、FASTA等 |
芯片数据分析 |
gP |
长链非编码RNA分析 |
CPAT |
数据可视化 |
R语言、Rstudio等 |
底层软件 |
Perl、Python、Cython等 |
RPACkage |
edgeR、DESeq、cummeRbund、rrBLUP、genetics等200个package |
R CODe |
主成分分析、离散程度分析、网络可视化等等 |
三.最全面的分析服务培训
SEQPAD支持个性化的方案设计,为您提供为期两周的RNA-seq、micRNA、芯片等数据的全套分析流程培训内容。承接基因表达谱、MiRNA表达谱、SNP分型检测。
全国
四:全国范围招代理。
- 北京瑞博东方科技有限公司 [加为商友]
- 联系人荣翔(先生)
- 地区北京
- 地址北京市亦庄经济开发区黄亦路139号